连云区委、区政府始终把教育摆在优先发展的战略地位，建立了涵盖学前教育、基础教育、职业教育、特殊教育在内的教育体系。连云区现有职业中专1所，中小学16所（其中普通高中2所、初中5所、小学8所、民办九年制学校1所）。全区在校学生21768人，其中中专2085人、高中1650人、初中5754人、小学12279人。幼儿园27所，在园幼儿3564人，其中公办园17所（含1所军办园）、民办园10所。全区共有教职工1594人。

职业中专1所，江苏省大港中等专业学校，位于连云港市经济技术开发区中云街道。现有65个中专班，3个五年制高职班，合计68个班，2085人。

普通高中2所，位于连云新城，分别为连云港市海滨中学、连云港市苏外高级中学（民办）。

初级中学5所7个校区，分别是位于云山街道的连云港市东港中学云山校区；海州湾街道的连云港市东港中学海棠校区、连云港市东港中学新城校区；墟沟街道的连云港市西苑中学、连云港市新港中学；连云街道的连云港市连云中学；板桥街道的连云港市板桥中学。

小学8所，分别是位于墟沟街道的连云港市墟沟中心小学、连云港市院前小学、连云港市东港小学；位于海州湾街道的连云港市海州湾小学；位于云山街道的连云港市云山小学；位于连云街道的连云港市临海路小学；位于宿城街道的连云港市宿城中心小学；位于板桥街道的连云港市板桥中心小学。

民办九年制义务教育学校1所，位于连云新城的连云港市苏州外国语学校。